針對台灣師範大學女子足球隊抽血爭議，行政院於17日院會中多次表態將嚴肅面對。行政院發言人李慧芝表示，行政院長卓榮泰已明確指示「學生權益保障為當前最重要原則」，並要求教育部及國科會徹查校方處理過程，必要時將究責相關單位，國科會副主委蘇振綱也允諾，會在2個月的期間內向社會大眾做完整報告。教育部政務次長朱俊彰則說明，已要求台師大在三天內提出對學生完善的輔導措施，也會追蹤學校是否落實。

蘇振綱表示，目前國科會已組成包含法律、研究倫理、生醫與體育等領域9位成員的專案小組，並針對所有涉及人體試驗的研究計畫與論文展開全面清查，預計2個月內向社會完整說明。對於師大先前提交的調查報告，國科會認為尚有諸多不足，將視需要擴增專家學者參與調查。

對於案中涉及的抽血樣本用途、是否用於未經同意的研究論文，以及早在去年底即知情但未即時處理的質疑，蘇振綱強調，自2023年11月起即三度召開專案小組審查，未曾放棄調查，並表示會與教育部協同處理。

教育部次長朱俊彰指出，早於去年底接獲民進黨立委陳培瑜反映後，即責成師大對「霸凌」與「研究倫理」進行立案調查。霸凌部分，教育部已掌握學校於3月認定事實成立並建議解聘兩年不予任用，但校內三級教評會最終在6月做出較輕處分，教育部認為「輕輕放下」不當，已要求重啟審查。

在研究倫理方面，朱俊彰指出師大的說明避重就輕、內容不清，已要求補件與裁罰，並承諾將從嚴監督學校改進調查與懲處程序。

為安撫受害學生情緒，朱俊彰強調，已要求台師大在三天內提出完整心理輔導計畫，提供免費且足量的校內外心理諮詢資源，並由教育部親自追蹤落實情況，與學生持續對話，主動掌握學生訴求與建議。

李慧芝強調，行政院亦表示支持台北地檢署介入調查，盼重塑社會信任與公平正義。