Noong ika-4 ng Nobyembre, parehong naglabas ng pahayag ang Ministro ng Depensa at Ministro ng Ugnayang Panlabas ng Japan upang ipakita ang kanilang suporta sa Taiwan. Binanggit ni Defense Minister Shinjiro Koizumi ang kahalagahan ng kapayapaan at katatagan sa Taiwan Strait. Samantala, sinabi ni Foreign Minister Toshimitsu Motegi na kaugnay ng pagpupulong ng Japan Prime Minister Sanae Takaichi sa Taiwan representative Lin Hsin-i sa APEC Summit, na kinondena ng China, ipinaalam na Japan ay nananatiling sumusunod sa nakasaad na posisyon nito, at ang pagpupulong ay hindi lumalabag dito.
Noong ika-2 ng Nobyembre, dumalo si Koizumi sa ADMM-Plus meeting sa Malaysia, kung saan nakipag-usap siya sa Chinese Defense Minister Dong Jun at binigyang-diin ang kahalagahan ng pagpapanatili ng kapayapaan sa Taiwan Strait. Sa isang press conference pagkatapos ng cabinet meeting noong ika-4, muling inulit ni Koizumi ang posisyon ng pamahalaan ng Japan.
Ayon kay Koizumi, may malapit na ugnayan sa ekonomiya at tao ang Taiwan at Japan, at itinuturing itong mahalagang kasosyo at kaibigan ng Japan. Karamihan sa enerhiya at pagkain ng Japan ay umaasa sa pandaigdigang kalakalan, kaya’t napakahalaga ang seguridad sa dagat. Binanggit niya na ang Taiwan ay nasa mahalagang lokasyon kung saan nagtatagpo ang South China Sea, Bashi Channel, East China Sea, at Pacific Ocean, at itinuturing na pangunahing maritime lifeline ng Japan.
Idinagdag ni Koizumi na sa ilalim ng bisyon na “Free and Open Indo-Pacific”, kailangang itaguyod ang isang pandaigdigang kaayusang nakabatay sa batas, at ang kapayapaan at katatagan sa rehiyon ay mahalaga. Ang kapayapaan sa Taiwan Strait ay hindi lamang kritikal sa seguridad ng Japan kundi pati na rin sa katatagan ng internasyonal na komunidad.
Sinabi rin niya na patuloy na magsusumikap ang Ministry of Defense at Japan Self-Defense Forces upang mapanatili ang kapayapaan at katatagan sa rehiyon, at handa sa anumang posibleng sitwasyon upang maprotektahan ang kalayaan, kapayapaan, at buhay ng mga mamamayan ng Japan.
Samantala, noong Oktubre 31 at Nobyembre 1, nag-post si Prime Minister Sanae Takaichi sa social media ng mga larawan ng kanyang pagpupulong kay Lin Hsin-i. Tinuligsa ito ng Chinese Ministry of Foreign Affairs, na nagsabing ang hakbang ng Japan ay nagpadala ng “malubhang maling signal sa pro-Taiwan independence forces” at may “masamang epekto.”
Sa isang press conference noong ika-4 ng Nobyembre, sinabi ni Motegi na ang APEC, na binubuo ng 21 bansa at ekonomiya, ay nagiging normal na lugar para sa ganitong mga pagpupulong, at may maraming nakaraang pagkakataon na nakipagpulong ang Japan Prime Minister sa mga kinatawan ng Taiwan. Ayon sa kanya, “Batay sa 1972 Japan-China Joint Communiqué, ang ugnayan ng Japan at Taiwan ay non-governmental at practical, at ang pagpupulong na ito ay hindi lumalabag sa posisyon ng pamahalaan ng Japan.”
Binigyang-diin niya: “Sa mga nakaraang APEC summits, maraming pagkakataon na nagkaroon ng pagpupulong ang Japan Prime Minister at Taiwan representative. Ipinahayag namin sa China na ito ay karaniwang gawain at malinaw naming pinanatili ang posisyon. Sa kabila ng protesta ng China, hindi nagbago ang pangunahing posisyon ng Japan sa Taiwan issue.”