對於敦睦艦隊傳出COVID-19(武漢肺炎)疫情，蔡英文總統今天(19日)發表3點聲明，要求國軍徹底檢討防疫管理作為；對於防疫缺口要坦誠以對，不可再有任何疏漏；同時恪守指揮中心的規定，做好隔離或健康管理。總統府也表示，參謀總長黃曙光曾在16日入官邸開會，但所有人員都有遵守防疫規定，環境也經過消毒，指揮中心研判風險較低，醫療團隊仍會密切注意總統的健康。

海軍敦睦艦隊已有24人確診武漢肺炎，總統府發言人張惇涵轉述蔡英文總統的3點聲明，首先要求國軍徹底檢討防疫管理。張惇涵：『(原音)總統認為防疫視同作戰，國軍的責任是保護國家與國人，更應該要保持最高度的警覺。這次敦睦艦隊集體染疫，造成社會大眾的疑慮，總統表示遺憾，也認為國軍除了要表達對社會致歉、願意承擔應有的責任之外，更應該以此為鑑，徹底檢討防疫相關管理作為。』

其次，總統表示，國軍除了應該全力配合指揮中心的疫調外，國防部調查小組也應詳細釐清過程，既然已造成防疫缺口，就要坦誠以對，絕不可以再有任何疏漏，這不但攸關國內疫情的管控，也關乎社會對國軍的信任，沒有絲毫鬆懈的空間。

最後，總統要求所有涉及的國軍人員必須嚴格遵守疫情指揮中心的指引與規定，做好個人的隔離或健康管理措施，也請軍方和醫療體系全力照顧染疫官兵，務必做好國軍的整體健康與戰力維繫。

對於有媒體詢問蔡總統是否曾在4月15日之後與參謀總長黃曙光會面一事，總統府說明，黃曙光曾於4月16日赴官邸參加例行會議，但當日會議的座位皆間隔1.5公尺以上社交距離，與會人員也全程配戴口罩、事先量測體溫、進行手部及鞋子消毒，會議場所及設備更高頻次進行消毒作業。

總統府表示，為因應防疫必要，總統相關會議的防疫部署都依照中央流行疫情指揮中心的專業指導，從嚴安排。總統府在與中央流行疫情指揮中心討論後，指揮中心研判風險雖然相對較低，但為求慎重，將請醫療團隊更嚴密關注總統的日常健康狀況。