總統府前副秘書長羅智強今天(17日)晚上在臉書上表示，新任教育部長吳茂昆在2004年擔任國科會主委期間，曾任中國軍用公司「西部超導材料科技有限公司」的技術顧問。對此，吳茂昆晚上再發聲明強調，這完全是莫須有的指控，他2004年還在國科會，不可能去接任何中國的職務。
吳茂昆指出，他確實知道這個公司，其以前的負責人為中國的院士，但他從來沒有去過這間公司，更沒有接受過任何這間公司的職務。